Ancient Wonders: Atlantis to logiczna gra typu match-3 osadzona w legendarnym, zatopionym mieście Atlantyda, w której zadaniem jest łączenie identycznych kafelków na heksagonalnej planszy i tworzenie jak najdłuższych łańcuchów, aby odblokowywać potężne efekty oraz nagrody. Rozgrywka łączy strategiczne planowanie ruchów z dynamicznymi reakcjami łańcuchowymi, pozwalając przebijać się przez starożytne przeszkody i odkrywać ukryte skarby. W trakcie kolejnych poziomów możliwe staje się również stopniowe przywracanie elementów legendarnej Atlantydy do życia.